高士奇是浙江余额人，顺治二年生，十八年入籍杭州，补了杭州府生员，康熙三年时随其父游学京师，其年二十岁。父子二人到了京城后，原本是想在京城谋个生计，好就近应读参加科举，一举迈入龙门。哪知其父到了京城后不久就一病呜呼了，囊羞涩的高士奇忍着悲痛东借西凑把父亲给葬了，之后便在街卖字为生。二十六岁那年时来运巧，竟然被人进了太学，如此生活才稍有转机。康熙十年时，康熙这位不满二十岁的年青皇帝，在铲除鳌拜等辅政大臣后，亲试太学生，结果高士奇因辞、法俱一流而荣登榜首，御试第一。同年五月，康熙即钦命高士奇为其抄写经筵讲义，由此高士奇才算真正入仕了。

成了经抄写官后，高士奇便兢兢业业，唯恐有负康熙所托，十万分的小心，生怕哪里出错。每夜成后，与妻对读常至半夜，直到确认误后才敢呈给康熙。正因他如此小心谨慎，故而翌年七月二十五日，康熙便在懋勤殿破格地接见了这位抄写员，且特赐内缎。而高士奇也不失机会，献《东巡赋》，既表达了对皇的忠心，又显现出自己的才华，得到康熙的赏识，被补为詹事府录事。

康熙十六年，高士奇以录事随康熙行南苑，从此高士奇就成了康熙的随从。为此高士奇曾得意地写下“自笑功名薄，谁知雨露深”的诗句。同年冬，高士奇又升任内阁舍人，食六品俸。康熙赐御“忠孝”二字。康熙十九年五月三藩平定后，康熙又谕吏部曰：高士奇学问淹通，居职勤慎，供奉有年，应授为翰林院。吏部议叙后，授高士奇为额外翰林院侍讲。三年后的康熙二十二年，高士奇又被补为侍读充日讲起居住官，并且成了相当于内阁的南房行走，虽然品级不过三品，但实际已是行使的宰相之权，其所得宠信冠居满朝汉官之，是为汉官第一人。

高士奇入了南房，成了康熙最宠信的汉臣后，便被朝的两大势力明珠与索额图两派争相拉拢，最后高士奇权衡利弊，选择了亲近明珠。他此行来到关外，便是明珠力主的结果，因为他的差事便是查探有关都察院左都御史马齐密奏的宁古塔吴逆杀官造反一事。而此事的当事人宁古塔将军巴海似已搭索额图这条线，其在关外对罗刹人的退让让一心要将罗刹人赶走的明珠恼怒，也让对巴海负有重望的康熙不满，他虽称赞过巴海为关外“擎天之柱”，但时过境迁，当年的小皇帝已经成为主宰一切的天子，他已经不需要再依靠任何人，也不需要仰仗什么人，所以那擎天之柱也变得可有可。而在收到马齐密奏前，康熙竟然对此事一所知，宁古塔的巴海也在奏折对此事只字不提，这让康熙不由不重新审视起这位昔年的擎天之柱来，他需要搞清事实真相，他不允许任何臣子欺瞒自己。

如果单单是对罗刹人退让，康熙也不会对巴海有什么不满，但此事牵连到昔年让自己为之绞尽脑汗，提心吊胆的吴逆叛军，康熙不能不发火，也不能不重视。考虑到巴海在宁古塔为官三十多年，当地的官员多是他的子弟门人，根基深厚，其本身又是议政大臣兼宁古塔将军，派一般的人去不定能查出真相，所以在明珠的建议下，康熙便让高士奇出关查访，务必查出事情真相。

高士奇是微服到的关外，一到宁古塔，其也未去拜会巴海和宁古塔的官员，而是偷偷的召见了几个官员，从他们口得知了松山堡吴逆叛逃北，伏杀镶红旗舒穆禄和黑龙江正黄旗何保部数百官兵的真相。得知事情经过后，高士奇是既惊又怒，惊得是巴海胆大包天，治下出了这么大的事情竟然还捂着不报朝廷，怒的是那些吴逆当真是一帮反贼，本心不改，竟然敢复叛朝廷，而且样子好像已经与罗刹人勾结，实是汉奸国贼疑。

恼怒之下的高士奇也不立即前去将军府找巴海质问，而是不露声色的离开，一路快马加鞭便要回京将此事真相告于皇，然他不知道的是，在其到达宁古塔之前，巴海便已经知道皇派了高士奇来查他，而且也知道此行所来为何。不过巴海却也不惊慌，明面佯做不知高士奇来，暗地里却派了亲信赶往京城找索额图，算来巴海亲信这会已经是到了盛京，比蒙在鼓子里的高士奇快了一步。