讨桂各军一部分撤返广州，准备北伐。
此时，雄心勃勃的孙中山，召集粤军将领、内河舰队及飞机队管带，作动员讲话：“此次粤军进攻广西，不到一月就把桂系荡平，乃将士用命所致。现在两湖已发生战争，当出兵北伐，统一中国，北伐之举势在必行，偏安一隅，只能苟全，而非久安，希望将士用命，戮力北伐。”
十月八日孙中山向广州国会提出北伐案，获得通过，十八日，在广州举行北伐誓师大会。
孙中山决定由桂林取道湘省北伐。偕胡汉民、许崇智等离广州，沿西江入广西。在广西沿途巡视，经三水至梧州。
在梧州时曾向国民党员演讲：“梧州的革命党部甫告成立，今天各位出席成立大会，人数虽只是二百人之谱，可是革命不在人多，如果要使广西永远成为革命党的基地，机关枪、过山炮都不可能，唯有革命主义才是力量的源泉。我们必需要把革命真理传播出去，这个责任就在各位身上。如果我们成功了，中华民国就会得救，就会富强。如果我们失败，将来陆、谭、马、莫诸强盗就会卷土重来，广西数百万人民又将沦为奴隶了。”
这时候陈炯明率部驻防南宁，他仍反对北伐。
孙中山曾电促陈出兵，陈置之不理，且屯兵不进，扬言至少在半年以内休养整训。
孙无奈，赴桂林之前，亲往南宁防陈。
他知道陈的心思，便对孙说：“你应该支持我北伐。从利害观点论，我北伐后，如果成功，中国统一，我当然不会再回广东来。如果不幸而失败，我又有何颜回到两广。所以我北伐后，两广一切全权由你主持，不过请你不要阻止我北伐，并且请切实接济饷械。”
这番话是说到了陈的心里，但陈对北伐仍没明确态度，但似乎不像先前那样反对了。
不久他奉孙中山命回广州筹备北伐军饷、补给，回粤后，借机先把广东省的财权紧紧抓到手中。
孙中山在到南宁时，曾在群众大会发表演讲，主题是“广西善后方针”。
他开门见山：“我是第一次到广西，所以也是第一次到南宁，……大家都知道广西是个贫瘠的省份，可是这次溯江西上，所见两岸都是肥沃的平原，甚至山林丘壑也都苍蔚，因此我发见所谓的贫瘠，并不是真的贫瘠，而只是人事未到而已。”
接着就开发利源建设地方，兴借外债，修筑铁路，开矿山，树农场，建工厂等项大为发挥，使听众耳目一新，可谓振聋发聩。
不过也有人说他是善放空炮，还拿出当年他去北京见袁世凯，到处声称十年修二十万公里铁路之旧事拿来调侃。
孙中山从南宁折返梧州，再由梧州沿漓江过昭平，沿途系乘帆船溯江而上，从昭平至阳朔，路更险峻，梧州阳朔间虽然才四百五十里，整整就走了十六天。
孙在阳朔发表演说，同样语出惊人：“阳朔是块好地方，万山环绕，遍地膏腴。无知识人的以为这是土瘠民贫，可是却不知道奇峰耸峙的高山，都是石灰岩层的蓄积，可以烧石灰，可以制水门汀。所以别人认为阳朔是不毛之地，我则认为阳朔遍地都是黄金，所以我们应该拟定一套计划，把蕴藏在石灰岩层中的煤、铁、金、银、铅、水银诸矿，大量开发出来。”
孙中山在阳朔没有停留，即由阳朔赴桂林。
孙中山打定主意在桂林整备军队，组织北伐大本营。
当时在桂林的部队有粤军第二军许崇智部、福（福建）军李福林部。
此前，孙中山已委派朱培德为滇军总司令、彭程万为赣军总司令、谷正伦为黔军总司令、李烈钧为大本营参谋长、胡汉民为文官长。
朱培德（1888年10月29日—1937年2月17日），字益之，祖籍云南省安宁县。出生于仕宦之家，书香之门。其先祖朱化孚为明朝湖广按察使，其父朱秉堃系清朝举人。朱秉堃出任广通（今属禄丰县）猴盐井山长时，携全家同往。
一八九二年，父亲去世，四岁朱培德与长兄朱润德、幼弟朱树德一道被叔父朱秉鉴接回安宁。从此朱培德由祖母抚养，先入私塾，后上高小。少年时读书之余，又喜欢弓马骑射。
一九零七年，朱培德进入云南昆明陆军第十九镇营部武备学堂学习。一九零九年八月，云南陆军讲武堂成立，将该营部武备学堂合并，朱培德十一月入学，就学于云南武备学堂第一期步兵科丙班，与朱德、范石生、金汉鼎、唐淮源等同学，接受严格的军事训练。此时同盟会云南支部在讲武堂和云南新军中甚为活跃，朱培德受到革命思潮的影响，常秘密阅读革命书籍，倾向反清革命，不久加入中国同盟会。
毕业后任滇（新）军第十九镇（统制钟麟）三十七协（统领蔡锷）七十三标（统带丁锦）第二营第七队队官。武昌起义爆发，朱培德参加了云南“重九起义”。先后担任排长、连长、营长。
一九一六年二月二十日，护国第二军在总司令李烈钧的指挥下，由昆明出发，取道蒙自，东出开（化）广（南），进入桂粤，朱培德支队为前头部队，他处处以身作则，出师以后，很快就成为方声涛梯团的主力。
三月十五日龙潭（今广南县境）一役，首战告捷，全歼龙觐光犯滇先遣司令李文富一千余人。
五月十二日抵达广东省的重镇肇庆，朱培德支队奉命改编为第二军第二十五团，由朱培德担任团长，随即奉命转向北江。
七月六日，朱培德奉命迎击源潭二万援军，率领忠勇善战官兵五百余人，直插援敌心脏，俘虏敌军二千余人，创造了全军以少胜多的光辉战例。不久，升任升为羊城（广州）攻略军司令。
十月二十一日，朱培德被北洋政.府授为陆军少将。十一月李烈钧在各方面压力下辞护国军第二军总司令职，护国军第二军入广东的部队改称驻粤滇军，编为两个师，朱培德晋升为驻粤滇军第四师（师长方声涛）第七旅旅长，驻守广州市区，其本人加入了孙中山的中华革命党。